Pans Labyrint skildrer to verdener: En fantasiverden med feer, falangister og fantasifostre og en virkelig verden med de barske realiteter fra 1930´ernes borgerkrig i Spanien. Da pigen Ofelia flytter med sin mor op i bjergene hos generalen, som moderen netop har giftet sig med, starter eventyret på godt og ondt. Ofelia møder monstre og feer der mener de kender hendes virkelige identitet som prinsesse for underverdenen, og møder samtidig en krigsliderlig general, der forlanger hun kalder ham far. Hun udsættes for mange prøver både i underverdenen og i den virkelige verden, men heldigvis får hun også hjælp fra både feer og hushjælpen Mercedes.